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* 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf|Structure Modeling]] | * 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf|Structure Modeling]] | ||
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Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 14-15. Januar 2015
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 20-21. Januar 2014
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 23-25. Januar 2013
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 12/13. Januar 2012
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 26/27. Januar 2011
- MD Simulation, Beilstein Computer Center, 15. und 19. Januar 2010
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 14. Januar 2010
- Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 13. Januar 2009
Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengänge Bioinformatik und Biochemie)
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
- 15.04.2014 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
- 22.04.2014 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie (P. Güntert)
- 29.04.2014 Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie (P. Güntert)
- 06-20.05.2013 MD Simulation: Theorie, Bewegungsgleichungen, Erhaltungsgrößen, Integration der Bewegungsgleichungen, Temperatur- und Druckanpassung (P. Güntert)
- 27.05. - 15.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
- 30.06.2014 Übungsaufgaben (P. Güntert)
- 08.07.2014 Lösungen der Übungsaufgaben (P. Güntert)
- 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die statistische Physik
Beginn: 25.10.2012
Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik)
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
- 16.04.2013 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
- 23.04.2013 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie (P. Güntert)
- 30.04.2013 Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie (P. Güntert)
- 07-21.05.2013 MD Simulation: Theorie (P. Güntert)
- 28.05. - 9.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
- 16.07.2013 Klausur
Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie
- Docking (Daten), Beilstein Computer Center, 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
- Docking, Beilstein Computer Center, 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)
Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik
- 19.10.2012 Einführung
- 26.10.2012 Finding information: Literature, Proteins, Alignments
- 02.11.2012 Pairwise Sequence Alignment
- 09.11.2012 Scoring of Alignments
- 30.11.2012 Alignment Algorithms
- 07.12.2012 BLAST and Alignment Significance
- 14.12.2012 Phylogeny
- 21.12.2012 Übungsaufgaben
- 18.01.2013 Lösungen der Übungsaufgaben
- 25.01.2013 Protein Data Bank (PDB)
- 08.02.2013 Protein Structure Similarity
- 15.02.2013 Structure Modeling
Biophysikalische Chemie IV (BPC IV)
- NMR Strukturbestimmung, 3. Dezember 2012
- NMR Strukturbestimmung, 30. November 2009
Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik)
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben
- Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
- Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
- Mo 11.06.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie und NMR (P. Güntert; Blockkurs 9:00-17:00)
- Di 12.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Theorie (P. Güntert; Blockkurs 9:00-17:00)
- Do 14.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Anwendungen (O. Mirus)
- Do 21.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Anwendungen (O. Mirus)
- Do 28.06.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
- Do 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
- Do 12.07.2012 Klausur
Uebungen: Mi 10:00-17:00, N100 0.12c (Beilstein-Zentrum)
- 20.06.2012 MD Simulation mit YASARA
- 27.06.2012 MD Simulation mit YASARA
Eintrag im Vorlesungsverzeichnis Masterstudiengang Bioinformatik
Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I)
- 21.10.2011 Konformation von Polypeptiden
- 04.11.2011 Struktur von Proteinen
- 18.11.2011 Primärstruktur
- 02.12.2011 Nicht-regelmäßige Sekundärstruktur, Sekundärstrukturvorhersage, Strukturmotive
- 09.12.2011 Strukturklassen und α-helikale Proteine
- 13.01.2012 β-Blatt Proteine
- 27.01.2012 Oligomere
- 03.02.2012 Protein Data Bank (PDB)
- 10.02.2012 Strukturanalysetools und Strukturvorhersage
Computergestützte Strukturbiologie (Strukturelle Bioinformatik)
- Aufbau und Konformation von Polypeptiden, 23. April 2009
- Einführung in die räumliche Struktur von Proteinen, 23. April 2009
- Strukturbestimmung mit Röntgenkristallographie, 30. April 2009
- Strukturbestimmung mit NMR Spektroskopie, 30. April 2009
- Computer-Simulation von Molekülen, 7. Mai 2009
- Kraftfelder, 14. Mai 2009
- MD Algorithmen, 28. Mai 2009
- MD Simulation im Torsionswinkelraum, 4. Juni 2009
- Protein Data Bank, 4. Juni 2009
- Comparative protein structure modeling, 18. Juni 2009
- Fold recognition, 25. Juni 2009
- New fold prediction, 2. Juli 2009
- Membrane proteins, 9. Juli 2009
- Uebungsaufgaben, 9. Juli 2009
