Teaching

Revision as of 18:33, 14 January 2014

Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die statistische Physik

Beginn: 25.10.2012

Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik)

Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben

• 16.04.2013 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
• 23.04.2013 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie (P. Güntert)
• 30.04.2013 Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie (P. Güntert)
• 07-21.05.2013 MD Simulation: Theorie (P. Güntert)
• 28.05. - 9.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
• 16.07.2013 Klausur

Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie

• Docking (Daten), Beilstein Computer Center, 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
• Docking, Beilstein Computer Center, 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)

Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik

• 19.10.2012 Einführung
• 26.10.2012 Finding information: Literature, Proteins, Alignments
• 02.11.2012 Pairwise Sequence Alignment
• 09.11.2012 Scoring of Alignments
• 30.11.2012 Alignment Algorithms
• 07.12.2012 BLAST and Alignment Significance
• 14.12.2012 Phylogeny
• 21.12.2012 Übungsaufgaben
• 18.01.2013 Lösungen der Übungsaufgaben
• 25.01.2013 Protein Data Bank (PDB)
• 08.02.2013 Protein Structure Similarity
• 15.02.2013 Structure Modeling

Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie

• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 20-21. Januar 2014
• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 23-25. Januar 2013
• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 12/13. Januar 2012
• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 26/27. Januar 2011
• MD Simulation, Beilstein Computer Center, 15. und 19. Januar 2010
• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 14. Januar 2010
• Strukturrechnung mit CYANA, Beilstein Computer Center, 13. Januar 2009

Biophysikalische Chemie IV (BPC IV)

• NMR Strukturbestimmung, 3. Dezember 2012
• NMR Strukturbestimmung, 30. November 2009

Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik)

Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben

• Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
• Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
• Mo 11.06.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie und NMR (P. Güntert; Blockkurs 9:00-17:00)
• Di 12.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Theorie (P. Güntert; Blockkurs 9:00-17:00)
• Do 14.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Anwendungen (O. Mirus)
• Do 21.06.2012 Moleküldynamiksimulation: Anwendungen (O. Mirus)
• Do 28.06.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
• Do 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
• Do 12.07.2012 Klausur

Uebungen: Mi 10:00-17:00, N100 0.12c (Beilstein-Zentrum)

• 20.06.2012 MD Simulation mit YASARA
• 27.06.2012 MD Simulation mit YASARA

Eintrag im Vorlesungsverzeichnis Masterstudiengang Bioinformatik

Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I)

• 21.10.2011 Konformation von Polypeptiden
• 04.11.2011 Struktur von Proteinen
• 18.11.2011 Primärstruktur
• 02.12.2011 Nicht-regelmäßige Sekundärstruktur, Sekundärstrukturvorhersage, Strukturmotive
• 09.12.2011 Strukturklassen und α-helikale Proteine
• 13.01.2012 β-Blatt Proteine
• 27.01.2012 Oligomere
• 03.02.2012 Protein Data Bank (PDB)
• 10.02.2012 Strukturanalysetools und Strukturvorhersage

Computergestützte Strukturbiologie (Strukturelle Bioinformatik)

• Aufbau und Konformation von Polypeptiden, 23. April 2009
• Einführung in die räumliche Struktur von Proteinen, 23. April 2009
• Strukturbestimmung mit Röntgenkristallographie, 30. April 2009
• Strukturbestimmung mit NMR Spektroskopie, 30. April 2009
• Computer-Simulation von Molekülen, 7. Mai 2009
• Kraftfelder, 14. Mai 2009
• MD Algorithmen, 28. Mai 2009
• MD Simulation im Torsionswinkelraum, 4. Juni 2009
• Protein Data Bank, 4. Juni 2009
• Comparative protein structure modeling, 18. Juni 2009
• Fold recognition, 25. Juni 2009
• New fold prediction, 2. Juli 2009
• Membrane proteins, 9. Juli 2009
• Uebungsaufgaben, 9. Juli 2009

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