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== Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) ==
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17-19. Januar 2022
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<!--* Vorlesung ''Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik'' ([[Media:210118_HandoutTD.pdf‎|PDF]])
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* Aufgaben ([[Media:210118_Aufgaben.pdf‎|PDF]])
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* Lösungen Aufgaben 1-2 ([[Media:210118_LoesungenAufgaben12.pdf‎|PDF]])
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* Lösungsblatt ([[Media:210118_Loesungsblatt.pdf‎|PDF]], [[Media:210118_Loesungsblatt.docx|Word]])
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* Lösungsblatt Ergebnisse ([[Media:210120_LoesungsblattErgebnisse.pdf‎|PDF]])
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* Simulationen Aufgabe 5 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe5.zip|ZIP]])
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* Simulationen Aufgabe 6 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe6.zip|ZIP]])
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<!--* Simulationssoftware CARNOT für [[Media:carnot-2.1-win.zip|Windows]], [[Media:carnot-2.1-mac.zip|MacOS]], [[Media:carnot-2.1-linux.zip|Linux]]
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18-20. Januar 2021
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* Vorlesung ''Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik'' ([[Media:210118_HandoutTD.pdf‎|PDF]])-->
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<!--* Vorlesung ''Einführung in die Simulationssoftware Carnot'' ([[Media:210118_HandoutCarnot.pdf‎|PDF]])-->
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<!--* Aufgaben ([[Media:210118_Aufgaben.pdf‎|PDF]])
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* Lösungen Aufgaben 1-2 ([[Media:210118_LoesungenAufgaben12.pdf‎|PDF]])
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* Lösungsblatt ([[Media:210118_Loesungsblatt.pdf‎|PDF]], [[Media:210118_Loesungsblatt.docx|Word]])
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* Lösungsblatt Ergebnisse ([[Media:210120_LoesungsblattErgebnisse.pdf‎|PDF]])
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* Simulationen Aufgabe 5 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe5.zip|ZIP]])
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* Simulationen Aufgabe 6 ([[Media:210120_SimulationenAufgabe6.zip|ZIP]])-->
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<!--* Simulationssoftware CARNOT für [[Media:carnot-2.1-win.zip|Windows]], [[Media:carnot-2.1-mac.zip|MacOS]], [[Media:carnot-2.1-linux.zip|Linux]]
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20-22. Januar 2020
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* [[Media:200120_Aufgaben1-6b.pdf‎|Aufgaben]]
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* [[Media:200120_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Vorlesung Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik]]
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* [[Media:carnot-1.3.zip|Simulationssoftware]]
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* [[Media:200120 LoesungenAufgaben1.pdf|Lösungen Aufgabe 1]]
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* [[Media:200120 LoesungenAufgaben1-2.pdf|Lösungen Aufgaben 1-2]]
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* [[Media:200122 ErgebnisseAufgabe5.pdf|Ergebnisse Aufgabe 5]]
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* [[Media:200122 ErgebnisseAufgabe6.pdf|Ergebnisse Aufgabe 6]]
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--><!--21-23. Januar 2019
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* [[Media:190121_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Vorlesung Mikroskopische Bewegung—makroskopische Thermodynamik]]
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* [[Media:190121_Aufgaben.pdf‎|Aufgaben]]
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* [[Media:carnot-1.2.zip|Simulationssoftware]]
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* [[Media:190123 Loesungen Aufgaben 2.3-3.2.pdf|Lösungen Aufgaben 2.3-3.2]]
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* [[Media:180122_BPCIThermodynamikStatistischeMechanik.pdf‎|Thermodynamik und Statistische Mechanik]], 22/24. Januar 2018
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* [[Simulation Setup]], 22/24. Januar 2018
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== Biophysikalische Chemie IV (BPC IV) ==
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* [[Media:201207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 7. Dezember 2020
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* [[Media:191118_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 18. November 2019
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* [[Media:181126_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 26. November 2018
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* [[Media:171127_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|Slides Vorlesung NMR Strukturbestimmung]], 27. November 2017
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* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 5. Dezember 2016
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* [[Media:151207_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 7. Dezember 2015
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* [[Media:121203_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 3. Dezember 2012
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* [[Media:091130_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 30. November 2009
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== Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
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* [[Strukturrechnung mit CYANA]], 16-18. Dezember 2019
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (Dez 2018)]], 17-19. Dezember 2018
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (Dez 2017)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 18-20. Dezember 2017
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (Jan 2016)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 20-21. Januar 2016
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2015)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 14-15. Januar 2015
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2014)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 20-21. Januar 2014
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2012)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 23-25. Januar 2013
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2012)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 12/13. Januar 2012
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26/27. Januar 2011
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* [[MD Simulation]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 15. und 19. Januar 2010
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 14. Januar 2010
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2009)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 13. Januar 2009
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== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengang Biochemie) ==
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==== Moleküldynamik-Simulation von Proteinen ====
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* [[Media:190617 SkriptMD.pdf|Skript Vorlesung MD Simulation]], 17. Juni 2019
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* [[Media:190617 SlidesMD.pdf|Slides Vorlesung MD Simulation]], 17. Juni 2019
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* [[Media:190619 TutorialMD.pdf|Tutorial MD Simulation]], 17/19. Juni 2019
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* [[Media:190619 TutorialMDAntwortenFragen.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial MD Simulation]], 19. Juni 2019
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==== Strukturmodellierug von Proteinen ====
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* [[Media:190624 SlidesModellig.pdf|Slides Vorlesung Strukturmodellierug]], 24. Juni 2019
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* [[Media:190624 Tutorial Modelling.pdf|Tutorial Strukturmodellierung]], 24/26. Juni 2019
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* [[Media:190626 AntwortenFragenTutorialModelling.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial Strukturmodellierung]], 26. Juni 2019
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== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengang Biochemie) ==
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==== Moleküldynamik-Simulation von Proteinen ====
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* [[Media:180618 SkriptMD.pdf|Skript Vorlesung MD Simulation]], 18. Juni 2018
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* [[Media:180618 SlidesMD.pdf|Slides Vorlesung MD Simulation]], 18. Juni 2018
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* [[Media:180618 TutorialMD.pdf|Tutorial MD Simulation]], 18/20. Juni 2018
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* [[Media:180627 AntwortenFragenTutorialMD.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial MD Simulation]], 27. Juni 2018
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==== Strukturmodellierug von Proteinen ====
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* [[Media:180625 SlidesModellig.pdf|Slides Vorlesung Strukturmodellierug]], 25. Juni 2018
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* [[Media:180625 Tutorial Modelling.pdf|Tutorial Strukturmodellierung]], 25/27. Juni 2018
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* [[Media:180627 AntwortenFragenTutorialModelling.pdf|Antworten zu Fragen im Tutorial Strukturmodellierung]], 27. Juni 2018
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Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
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* 15.04.2014 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
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* 22.04.2014 [[Media:140422 StrukturbestimmungXray.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie]] (P. Güntert)
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* 29.04.2014 [[Media:140429 StrukturbestimmungNMR.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie]] (P. Güntert)
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* 06-20.05.2013 [[Media:140506 MD Theorie.pdf|MD Simulation: Theorie]], [[Media:140506 Bewegungsgleichungen.pdf|Bewegungsgleichungen]], [[Media:140513 Erhaltungsgroessen.pdf|Erhaltungsgrößen]], [[Media:140520 IntegrationBewegungsgleichungen.pdf|Integration der Bewegungsgleichungen, Temperatur- und Druckanpassung]] (P. Güntert)
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* 27.05. - 15.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
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* 30.06.2014 [[Media:140630 Uebungsaufgaben.pdf|Übungsaufgaben]] (P. Güntert)
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* 08.07.2014 [[Media:140708 UebungsaufgabenLoesungen.pdf|Lösungen der Übungsaufgaben]] (P. Güntert)
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* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
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== Strukturelle Bioinformatik (Masterstudiengänge Bioinformatik und Biochemie) ==
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Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Di 8:15-11:00, wenn nichts anderes angegeben
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* 15.04.2014 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
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* 22.04.2014 [[Media:140422 StrukturbestimmungXray.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie]] (P. Güntert)
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* 29.04.2014 [[Media:140429 StrukturbestimmungNMR.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie]] (P. Güntert)
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* 06-20.05.2013 [[Media:140506 MD Theorie.pdf|MD Simulation: Theorie]], [[Media:140506 Bewegungsgleichungen.pdf|Bewegungsgleichungen]], [[Media:140513 Erhaltungsgroessen.pdf|Erhaltungsgrößen]], [[Media:140520 IntegrationBewegungsgleichungen.pdf|Integration der Bewegungsgleichungen, Temperatur- und Druckanpassung]] (P. Güntert)
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* 27.05. - 15.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
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* 30.06.2014 [[Media:140630 Uebungsaufgaben.pdf|Übungsaufgaben]] (P. Güntert)
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* 08.07.2014 [[Media:140708 UebungsaufgabenLoesungen.pdf|Lösungen der Übungsaufgaben]] (P. Güntert)
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* 04.08.2014 Klausur (10:00-12:00, Otto-Stern-Zentrum Hörsaal H3)
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== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die statistische Physik ==
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Beginn: 25.10.2012
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== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
 
== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
  
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* 16.04.2013 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
 
* 16.04.2013 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
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* 23.04.2013 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie (P. Güntert)
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* 23.04.2013 [[Media:130423 StrukturbestimmungXrayL.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie]] (P. Güntert)
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* 30.04.2013 [[Media:130430 StrukturbestimmungNMRL.pdf|Proteinstrukturbestimmung mit NMR Spektroskopie]] (P. Güntert)
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* 07-21.05.2013 [[Media:130507 MD TheorieL.pdf|MD Simulation: Theorie]] (P. Güntert)
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* 28.05. - 9.07.2013 MD Simulation Praxis, Strukturmodellierung und -vorhersage (O. Mirus)
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* 16.07.2013 Klausur
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* 26.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie/NMR (P. Güntert)
 
* 26.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie/NMR (P. Güntert)
 
* 03.05.2012 Proteinstrukturbestimmung mit NMR (P. Güntert)
 
* 03.05.2012 Proteinstrukturbestimmung mit NMR (P. Güntert)
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[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung&veranstaltung.veranstid=83818 Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]
 
[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung&veranstaltung.veranstid=83818 Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]
 
[http://www.cs.uni-frankfurt.de/index.php/de/studierende-studiengaenge/studierende-studiengaenge-master-bioinformatik.html Masterstudiengang Bioinformatik]
 
[http://www.cs.uni-frankfurt.de/index.php/de/studierende-studiengaenge/studierende-studiengaenge-master-bioinformatik.html Masterstudiengang Bioinformatik]
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== Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
 
== Anfängerpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
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* [[Media:DockingSkript2013.pdf|Docking]] ([http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Download/bpc1docking2013.tgz Daten]), [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
 
* [[Media:DockingSkript2013.pdf|Docking]] ([http://www.bpc.uni-frankfurt.de/guentert/Download/bpc1docking2013.tgz Daten]), [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26. März und 3. April 2013 (Vorbesprechung 19/20. März 2013)
 
* [[Media:100224_DockingAnleitung.pdf|Docking]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)
 
* [[Media:100224_DockingAnleitung.pdf|Docking]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 5. und 12. März 2010 (Vorbesprechung 3. bzw. 10. März 2010)
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== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik ==
 
== Aspekte der Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I) - Einführung in die Bioinformatik ==
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* 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf‎|Structure Modeling]]
 
* 15.02.2013 [[Media:130215 ProteinModeling.pdf‎|Structure Modeling]]
  
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== Fortgeschrittenenpraktikum in Biophysikalischer Chemie ==
 
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* [[Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 23-25. Januar 2013
 
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* [[Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 12/13. Januar 2012
 
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 26/27. Januar 2011
 
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* [[MD Simulation]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 15. und 19. Januar 2010
 
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2010)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 14. Januar 2010
 
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* [[Strukturrechnung mit CYANA (2009)|Strukturrechnung mit CYANA]], [http://www.bcc.uni-frankfurt.de/ Beilstein Computer Center], 13. Januar 2009
 
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== Biophysikalische Chemie IV (BPC IV) ==
 
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* [[Media:121203_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 3. Dezember 2012
 
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* [[Media:091130_BPCIVVorlesungNMRStrukturbestimmung.pdf‎|NMR Strukturbestimmung]], 30. November 2009
 
  
 
== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
 
== Strukturelle Modellierung (Masterstudiengang Bioinformatik) ==
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Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben
 
Vorlesung: Hörsaal N100 1.14; Do 8:00-11:00, wenn nichts anderes angegeben
  
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* 12.04.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
 
* 12.04.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
 
* 19.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie ('''N260 3.13'''; P. Güntert)
 
* 19.04.2012 Proteinstrukturbestimmung mit Röntgenkristallographie ('''N260 3.13'''; P. Güntert)
Line 87: Line 208:
 
* 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
 
* 05.07.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
 
* 12.07.2012 Klausur
 
* 12.07.2012 Klausur
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* Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
 
* Do 24.05.2012 Aufbau von Proteinen (O. Mirus)
 
* Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
 
* Do 31.05.2012 Strukturvorhersage (O. Mirus)
Line 135: Line 256:
 
* [[Media:090709_Uebungsaufgaben.pdf‎|Uebungsaufgaben]], 9. Juli 2009
 
* [[Media:090709_Uebungsaufgaben.pdf‎|Uebungsaufgaben]], 9. Juli 2009
  
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<!--Prüfungstermine zu dieser Vorlesung sind nur noch am 10.12.2009 möglich.  
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Prüfungstermine zu dieser Vorlesung sind nur noch am 10.12.2009 möglich.  
 
Terminvereinbarung zur mündlichen Prüfung bitte im Sekretariat Biophysikalische Chemie, Biozentrum Raum N230 1.04, bei [mailto:s.fachinger@bpc.uni-frankfurt.de Frau Sigrid Oğuzer-Fachinger], Tel. 069 798 29630.
 
Terminvereinbarung zur mündlichen Prüfung bitte im Sekretariat Biophysikalische Chemie, Biozentrum Raum N230 1.04, bei [mailto:s.fachinger@bpc.uni-frankfurt.de Frau Sigrid Oğuzer-Fachinger], Tel. 069 798 29630.
 
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[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfoPerson&publishSubDir=personal&personal.pid=2667&menuid=&topitem=members&subitem=#treeview Eintrag im Hochschulinformationssystem HISQIS]
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[https://qis.server.uni-frankfurt.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfoPerson&publishSubDir=personal&personal.pid=2667&menuid=&topitem=members&subitem=#treeview Eintrag im Vorlesungsverzeichnis]

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Thermodynamik in der Strukturbiologie (BPC I)

17-19. Januar 2022



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